ポケダン小説第６部 運命有す時、持たぬ闇 第１章までは台本形式小説。 原作をある程度はなぞっていますが、所々おかしい所も。
| 章数 | 話数 | 原作対応 |
| 序章 探検隊と、無き記憶 |
プロローグ 離すべきではないその手から | Chapter1 |
| 第１話 出会い | ||
| 第２話 取り返す、大事な物 | ||
| 第３話 探検隊リジェクト始動！！ 前半 後半 | Chapter2 | |
| 第１章 記憶、遠征、時の中 |
第４話 ある１日の話 | 対応無し |
| 第５話 異なる時 | ||
| 第６話 彼の思い、彼女の思い | Chapter3 | |
| 第７話 悲しい言葉と悲しい涙 | ||
| 第８話 苦しみと絶望のサンダーマイン作戦 | Chapter6 | 第９話 一晩の休息 |
| 第１０話 疎外された者 | Chapter6? | 第１１話 揺らぐ大地 刻む時（前編） | Chapter8前後 |
| 第１２話 揺らぐ大地 刻む時（中編） | Chapter9 | |
| 第１３話 揺らぐ大地 刻む時（後編） |